Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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