Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LmnaP48678 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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