Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp4P35123 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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