Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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Hoxd9P28357 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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Hoxd9P28357 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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