Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms