Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms