Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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