Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Rabgef1Q9JM13 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Rabgef1Q9JM13 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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