Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim39Q9ESN2 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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