Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Atxn3Q9CVD2 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atxn3Q9CVD2 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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