Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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