Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Q3U6N9 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Q3U6N9 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Q3U6N9 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms