Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cnn1Q08091 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms