Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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