Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms