Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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H2-Q1O19441 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
H2-Q1O19441 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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