Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms