Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Atxn3Q9CVD2 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atxn3Q9CVD2 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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