Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms