Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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