Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Usp27Q8CEG8 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Usp27Q8CEG8 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp27Q8CEG8 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Usp27Q8CEG8 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Usp27Q8CEG8 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Usp27Q8CEG8 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp27Q8CEG8 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms