Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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