Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rbbp4Q60972 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Rbbp4Q60972 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms