Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 AI182371-206ENSMUST00000226631 1680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a13-201ENSMUST00000015256 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm45515-201ENSMUST00000210796 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Acbd5-202ENSMUST00000114523 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms