Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Klhdc9Q3USL1 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms