Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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