Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
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