Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms