Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nub1P54729 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms