Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nedd1P33215 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms