Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Vpreb2P13373 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms