Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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Opn1mwO35599 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Opn1mwO35599 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Opn1mwO35599 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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Opn1mwO35599 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Opn1mwO35599 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Opn1mwO35599 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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