Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spns3Q9D232 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spns3Q9D232 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms