Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Gsdmc3-202ENSMUST00000185526 2179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Hacl1-214ENSMUST00000167175 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm37957-201ENSMUST00000192182 2303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Mgat4e-201ENSMUST00000052911 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm25301-201ENSMUST00000175285 113 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Zfp551-202ENSMUST00000120220 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 AC154314.1-201ENSMUST00000223995 2996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Slc12a4-202ENSMUST00000116429 3755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm44013-201ENSMUST00000204392 2262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm14204-202ENSMUST00000123944 5380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Kcns3-203ENSMUST00000217974 2314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 AC134607.2-201ENSMUST00000213983 231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 AC153974.1-201ENSMUST00000219012 430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Mgat5-202ENSMUST00000171405 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Teddm1a-201ENSMUST00000050660 1317 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gmfb-202ENSMUST00000111817 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gmfb-201ENSMUST00000079314 4171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 CT009550.4-202ENSMUST00000227369 3076 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm38272-201ENSMUST00000194431 2400 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Cd99l2-202ENSMUST00000080035 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 n-R5s43-201ENSMUST00000122739 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm29585-202ENSMUST00000187855 425 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 1700001L19Rik-202ENSMUST00000222604 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chic1Q8CBW7 Wdcp-206ENSMUST00000223551 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms