Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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NischQ80TM9 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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NischQ80TM9 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NischQ80TM9 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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