Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Shank3Q4ACU6 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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