Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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