Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms