Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Cntn3Q07409 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Cntn3Q07409 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Cntn3Q07409 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Cntn3Q07409 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Cntn3Q07409 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Cntn3Q07409 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms