Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Irx1P81068 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Irx1P81068 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Irx1P81068 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Irx1P81068 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Irx1P81068 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Irx1P81068 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Irx1P81068 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Irx1P81068 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms