Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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