Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms