Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms