Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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H2-Q1O19441 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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H2-Q1O19441 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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H2-Q1O19441 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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H2-Q1O19441 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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H2-Q1O19441 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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H2-Q1O19441 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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H2-Q1O19441 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
H2-Q1O19441 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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