Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Gm8356J3QPD3 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms