Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms