Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms