Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PcolceQ61398 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms