Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms