Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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